Situé à l'intérieur du Château, où sont présentées des expositions du patrimoine archéologique de la municipalité d'Alcoutim, avec un voyage historique qui a commencé il y a plus de 5 000 ans, couvrant les périodes néolithique, chalcolithique, romaine, wisigothique et islamique, pertinentes dans les recherches archéologiques menées ces dernières décennies à Alcoutim.

Ce musée présente l'histoire de l'art sacré des différentes églises de la municipalité. La collection est principalement composée de photographies et de panneaux.

Ce musée retrace toute l'histoire du fleuve Guadiana, du transport fluvial des minéraux aux différentes formes de pêche artisanale, en passant par les activités de contrebande de l'époque de l'Estado Novo. L'exposition de miniatures de José Murta, intitulée « Bateaux traditionnels du Bas Guadiana », est un point fort de ce musée.

Dans cette base, vous pourrez admirer une salle de classe des années 50\/60, avec tous les éléments et les matériaux utilisés à l'époque, depuis les pupitres en bois de vieux manuels, photo du tableau et cartes, entre autres.